Но когда король Гарольд видит Шрека и Фиону, особенной радости он не
испытывает. По идее, Фиону должен был освободить и взять в жены
Прекрасный Принц, но он, очевидно, опоздал. Далее оказывается, что мать
Принца — фея-Крестная Фионы, и они давно уже замышляют прибрать к рукам
Тридевятое королевство.

Крестная шантажом вынуждает короля нанять убийцу, чтобы избавиться от Шрека — Кота в Сапогах.
Но тот проваливает задание и просит Шрека позволить сопровождать его.
Шрек с друзьями похищает у Феи эликсир, который превращает в человека и
его, и Фиону — но ненадолго. Фиону, чтобы заклятие закрепилось, еще
нужно поцеловать. Но Крестная и Принц не сдаются и строят новые козни…
Шрек вместе со сказочными персонажами атакует замок. Фея-Крёстная
пытается уничтожить Шрека, но в последний момент её заклинание
превращает короля Гарольда в лягушку. В конце герои побеждают. Гарольд
благословляет Шрека и Фиону...